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Matthew Dillon
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1d1bbd6706
commit
62020a9865
22 changed files with 18 additions and 565 deletions
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import DS from 'ember-data';
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export default DS.Model.extend({
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characteristicName: DS.attr(),
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characteristicTypeId: DS.attr(),
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measurements: DS.hasMany('measurement', {async: true}),
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createdAt: DS.attr('date'),
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updatedAt: DS.attr('date'),
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deletedAt: DS.attr('date')
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});
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@ -1,13 +0,0 @@
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import DS from 'ember-data';
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import Ember from 'ember';
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var inflector = Ember.Inflector.inflector;
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inflector.irregular('genus', 'genera');
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export default DS.Model.extend({
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genusName: DS.attr(),
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species: DS.hasMany('species', {async: true}),
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createdAt: DS.attr('date'),
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updatedAt: DS.attr('date'),
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deletedAt: DS.attr('date')
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});
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@ -1,15 +0,0 @@
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import DS from 'ember-data';
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export default DS.Model.extend({
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textMeasurementTypeId: DS.attr(),
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txtValue: DS.attr(),
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numValue: DS.attr(),
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confidenceInterval: DS.attr(),
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unitTypeId: DS.attr(),
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notes: DS.attr(),
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testMethodId: DS.attr(),
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strain: DS.belongsTo('strain', {async: true}),
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characteristic: DS.belongsTo('characteristic', {async: true}),
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createdAt: DS.attr('date'),
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updatedAt: DS.attr('date')
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});
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@ -1,10 +0,0 @@
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import DS from 'ember-data';
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export default DS.Model.extend({
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speciesName: DS.attr(),
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genus: DS.belongsTo('genus', {async: true}),
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strains: DS.hasMany('strain', {async: true}),
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createdAt: DS.attr('date'),
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updatedAt: DS.attr('date'),
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deletedAt: DS.attr('date')
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});
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@ -1,15 +0,0 @@
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import DS from 'ember-data';
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export default DS.Model.extend({
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strainName: DS.attr(),
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strainType: DS.attr(),
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etymology: DS.attr(),
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accessionBanks: DS.attr(),
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genbankEmblDdb: DS.attr(),
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isolatedFrom: DS.attr(),
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species: DS.belongsTo('species', {async: true}),
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measurements: DS.hasMany('measurement', {async: true}),
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createdAt: DS.attr('date'),
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updatedAt: DS.attr('date'),
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deletedAt: DS.attr('date')
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});
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@ -8,13 +8,6 @@ var Router = Ember.Router.extend({
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Router.map(function() {
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Router.map(function() {
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this.route('login');
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this.route('login');
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this.route('about');
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this.route('about');
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this.resource('genera');
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this.resource('species');
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this.resource('strains');
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this.resource('strain', { path: '/strain/:strain_id' }, function() {
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this.resource('measurements');
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});
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this.resource('measurement', { path: '/measurement/:measurement_id' });
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});
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});
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export default Router;
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export default Router;
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@ -1,7 +0,0 @@
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import Ember from 'ember';
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export default Ember.Route.extend({
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model: function() {
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return this.store.find('genus');
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}
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});
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@ -1,7 +0,0 @@
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import Ember from 'ember';
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export default Ember.Route.extend({
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model: function() {
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return this.store.find('measurement');
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}
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});
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@ -1,7 +0,0 @@
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import Ember from 'ember';
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export default Ember.Route.extend({
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model: function() {
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return this.store.find('species');
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}
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});
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@ -1,7 +0,0 @@
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import Ember from 'ember';
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export default Ember.Route.extend({
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model: function() {
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return this.store.find('strain');
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}
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});
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@ -1,20 +1,9 @@
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<div class="flakes-navigation">
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<div class="flakes-navigation">
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<img src="img/logo.png" width="120">
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<img src="img/logo.png" width="120">
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|
{{#link-to 'about' tagName='li' href=false}}
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|
{{#link-to 'about'}}About{{/link-to}}
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{{/link-to}}
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{{/link-to}}
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@ -29,7 +18,6 @@
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<a href="" class="logo-wrap">
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@ -1,23 +0,0 @@
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<p class="flakes-message information">This is here for debugging, this page will be deleted.</p>
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@ -1,41 +0,0 @@
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@ -1,109 +0,0 @@
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@ -1,6 +0,0 @@
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<h2>Strains</h2>
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<li>{{#link-to 'strain' this}}{{strainName}}{{/link-to}}</li>
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|
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|
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|
}
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|
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Binary file not shown.
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12
server/mocks/authenticate.js
Normal file
12
server/mocks/authenticate.js
Normal file
|
|
@ -0,0 +1,12 @@
|
||||||
|
module.exports = function(app) {
|
||||||
|
var express = require('express');
|
||||||
|
var authenticateRouter = express.Router();
|
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|
|
||||||
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app.use('/api/authenticate', authenticateRouter);
|
||||||
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};
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||||||
|
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@ -1,77 +0,0 @@
|
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module.exports = function(app) {
|
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var express = require('express');
|
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var characteristicsRouter = express.Router();
|
|
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|
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var CHARACTERISTICS = [
|
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{
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id: 1,
|
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|
|
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characteristicTypeId: 1,
|
|
||||||
createdAt: "2015-01-27T10:19:25.156836Z",
|
|
||||||
updatedAt: "2015-01-27T10:19:25.156836Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
measurements: [1,6]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 2,
|
|
||||||
characteristicName: "Char02",
|
|
||||||
characteristicTypeId: 1,
|
|
||||||
createdAt: "2015-01-27T10:19:25.156836Z",
|
|
||||||
updatedAt: "2015-01-27T10:19:25.156836Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
measurements: [2,7]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 3,
|
|
||||||
characteristicName: "Char03",
|
|
||||||
characteristicTypeId: 1,
|
|
||||||
createdAt: "2015-01-27T10:19:25.156836Z",
|
|
||||||
updatedAt: "2015-01-27T10:19:25.156836Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
measurements: [3,8]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 4,
|
|
||||||
characteristicName: "Char04",
|
|
||||||
characteristicTypeId: 1,
|
|
||||||
createdAt: "2015-01-27T10:19:25.156836Z",
|
|
||||||
updatedAt: "2015-01-27T10:19:25.156836Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
measurements: [4,5,9,10]
|
|
||||||
}
|
|
||||||
]
|
|
||||||
|
|
||||||
characteristicsRouter.get('/', function(req, res) {
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'characteristics': CHARACTERISTICS
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
characteristicsRouter.post('/', function(req, res) {
|
|
||||||
res.status(201).end();
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
characteristicsRouter.get('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
var characteristics = CHARACTERISTICS.filter(function(c) {
|
|
||||||
return req.params.id.indexOf(c.id.toString()) > -1;
|
|
||||||
});
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'characteristic': characteristics[0]
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
characteristicsRouter.put('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
var characteristics = CHARACTERISTICS.filter(function(c) {
|
|
||||||
return req.params.id.indexOf(c.id.toString()) > -1;
|
|
||||||
});
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'characteristic': characteristics[0]
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
characteristicsRouter.delete('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
res.status(204).end();
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
app.use('/api/characteristics', characteristicsRouter);
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
@ -1,65 +0,0 @@
|
||||||
module.exports = function(app) {
|
|
||||||
var express = require('express');
|
|
||||||
var generaRouter = express.Router();
|
|
||||||
|
|
||||||
var GENERA = [
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 1,
|
|
||||||
genusName: "Genus One",
|
|
||||||
species: [1,2],
|
|
||||||
createdAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
updatedAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 2,
|
|
||||||
genusName: "Genus Two",
|
|
||||||
species: [3],
|
|
||||||
createdAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
updatedAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 3,
|
|
||||||
genusName: "Genus Three",
|
|
||||||
species: [4],
|
|
||||||
createdAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
updatedAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
}
|
|
||||||
];
|
|
||||||
|
|
||||||
generaRouter.get('/', function(req, res) {
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'genera': GENERA
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
generaRouter.post('/', function(req, res) {
|
|
||||||
res.status(201).end();
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
generaRouter.get('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
var genus = GENERA.filter(function(g) {
|
|
||||||
return req.params.id.indexOf(g.id.toString()) > -1;
|
|
||||||
});
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'genus': genus[0]
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
generaRouter.put('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
var genus = GENERA.filter(function(g) {
|
|
||||||
return req.params.id.indexOf(g.id.toString()) > -1;
|
|
||||||
});
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'genus': genus[0]
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
generaRouter.delete('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
res.status(204).end();
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
app.use('/api/genera', generaRouter);
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
|
@ -1,77 +0,0 @@
|
||||||
module.exports = function(app) {
|
|
||||||
var express = require('express');
|
|
||||||
var speciesRouter = express.Router();
|
|
||||||
|
|
||||||
var SPECIES = [
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 1,
|
|
||||||
genus: 1,
|
|
||||||
speciesName: "Species One",
|
|
||||||
strains: [1],
|
|
||||||
createdAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
updatedAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 2,
|
|
||||||
genus: 1,
|
|
||||||
speciesName: "Species Two",
|
|
||||||
strains: [2],
|
|
||||||
createdAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
updatedAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 3,
|
|
||||||
genus: 2,
|
|
||||||
speciesName: "Species Three",
|
|
||||||
strains: [3],
|
|
||||||
createdAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
updatedAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
id: 4,
|
|
||||||
genus: 3,
|
|
||||||
speciesName: "Species Four",
|
|
||||||
strains: [4],
|
|
||||||
createdAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
updatedAt: "0001-01-01T00:00:00Z",
|
|
||||||
deletedAt: null,
|
|
||||||
}
|
|
||||||
];
|
|
||||||
|
|
||||||
speciesRouter.get('/', function(req, res) {
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'species': SPECIES
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
speciesRouter.post('/', function(req, res) {
|
|
||||||
res.status(201).end();
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
speciesRouter.get('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
var species = SPECIES.filter(function(s) {
|
|
||||||
return req.params.id.indexOf(s.id.toString()) > -1;
|
|
||||||
});
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'species': species[0]
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
speciesRouter.put('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
var species = SPECIES.filter(function(s) {
|
|
||||||
return req.params.id.indexOf(s.id.toString()) > -1;
|
|
||||||
});
|
|
||||||
res.send({
|
|
||||||
'species': species[0]
|
|
||||||
});
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
speciesRouter.delete('/:id', function(req, res) {
|
|
||||||
res.status(204).end();
|
|
||||||
});
|
|
||||||
|
|
||||||
app.use('/api/species', speciesRouter);
|
|
||||||
};
|
|
||||||
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